五子棋棋谱的常用格式有如下几种：

.lib RenLib库格式，RenLib兼容
.txt 文本棋盘格式，RenLib兼容
.POS 黑石POS文件格式，RenLib兼容
.pdb GoRenjer PDB格式，RenLib兼容
.buf 未知，RenLib兼容
.ren RenJS游戏格式，RenLib兼容
.renjs RenJS游戏格式，RenLib兼容
.wzq 基地城市游戏格式，RenLib兼容
.sgf Smart游戏格式，RenLib兼容
.bdt 未知，RenLib兼容
.z5 ZFIVE格式
.lws Fiver6.8格式，ZFIVE兼容
.rns 黑石游戏记录格式，ZFIVE兼容
.fgf 连珠宝典格式（貌似和.sgf一样），ZFIVE兼容
.rdf Renju动态棋谱，RenLib兼容
.rif Renju动态棋谱，RenLib兼容

推荐的五子棋棋谱管理软件：

RenLib v3.7 汉化绿色版（全格式五子棋棋谱管理软件）

优秀的五子棋棋谱管理程序，在几年时间里，经过广大用户的使用和作者不断升级更新，其功能已经十分强大，是同类软件中的佼佼者。 几乎支持所有五子棋棋谱格式，包括：
SGF/Lib/TXT/BUF/PDB/BDT/POS/WZQ/RENJS/REN/RDF/RIF



下载地址：http://game.onegreen.net/Soft/HTML/40183.html

连珠终结者（RenjuSolver）

连珠终结者（RenjuSolver） 由旅美华人温向东开发的连珠对弈/辅助计算软件。可以进行打谱、解决对弈中出现的局面的攻防等问题，是目前中国连珠五子棋专业棋手广泛使用的工具。
支持棋谱格式：LIB、POS、ORC、SGF、ZJR、REMA


下载地址：http://game.onegreen.net/Soft/HTML/40208.html

连珠五子棋宝典 v8.45 简体中文免费绿色版

连珠五子棋宝典一个免费的连珠工具软件，具有人机对战、打谱、推演棋谱变化、配参考图、网上对局、录入、打印棋谱、棋谱资料管理、棋谱格式转换、连珠教学等功能 ，支持联众、中游、基地城市、ORC游戏中心、黑石、five6连珠妙手、ZFIVE打谱软件棋谱。

游戏功能特点
　　打谱功能：打谱时，可以随意在谱中前进、后退、增加注解及配参考图，软件能够忠实记录你的每一步推演过程，使你研究棋谱更方便。
　　录入棋谱：支持注解、带参考图的棋谱的录入。
　　网上对局：网上对局使你可以不用任何服务器的支持，轻松实现网上对局。对局时，可任意预设棋局，并具有悔棋、封盘、续盘、交谈等功能。
　　资料管理：采用数据库技术管理棋谱资料，可随时导入、备份棋谱。使你对棋谱的分类、检索更方便，棋谱资料的保存更安全。
　　连珠教学：连珠教学功能，既有使你轻松入门的初级教程，也有使你全面提高的中级教程，软件的资料库、教程库将在连珠宝典的主页不断更新。
　　教程制作：连珠可以帮您制作各种连珠教程，您可以随意剪切、裁剪棋盘，将其保存为彩色、黑白图像，或将其送入系统的剪贴板中，与其它编辑软件交互使用。
　　无论您是一位初学者还是一个业余棋手，连珠五子棋宝典一定会成为您的好帮手。



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上面三个软件是本人在众多软件中选出来认为最好的三个。大家如果有更好的，请推荐一下。